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免费微课 三代测序UMI定量转录组

发布时间:2019-07-10 06:50 来源:未知 编辑:admin

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  当三代测序赶上转录组会碰撞出如何的火花?

  它的“诱人之处”又在哪?

  “UMI”若何改变三代转录组?

  目前,利用三代测序手艺测定物种全长转录组的文献报道越来越多,以PacBio Sequel测序为代表的第三代测序手艺也根基成熟。

  三代测序能够间接获得全长转录本,从而可以或许从可变剪接、可变聚腺苷酸化、可变启动子、等位基因特异表达等方面解析转录组的多样性和复杂性,大大加深了转录组数据的操纵深度,比拟于NGS手艺集中在基因程度的表达定量,全长转录组也将使定量由基因程度提拔为转录本程度,对转录本多样性的切确解析及切确定量将更深层的揭示转录调控机制,从而变化转录组研究范式。

  为了提高三代转录组定性、定量精确性,处理二代测序在isoform定量上的问题,华大基因基于 “独立分子标签(UMI)”道理开辟了一套三代转录组手艺,实现PacBio全长转录组的基因定量和转录本定量。这一手艺添加了三代转录组定量的精确性,处理了二代测序不克不及对转录本亚型(isoform)定量的一大短处,且无效提高了新转录本的发觉活络度。

  科技君特地为大师预备的三代测序系列微课,第二节《三代测序UMI定量转录组》已上线,并再次邀请到华大股份研发副总监唐冲博士为大师主讲本次微课,与大师配合切磋相关三代测序转录组的使用技巧。

  三代测序UMI定量转录组

  为什么要做三代转录组

  三代转录组现状及特点

  “UMI”改变三代转录组研究模式

  华大股份研发副总监

  唐冲博士2012年结业于内华达大学生化与分子生物学专业,获得博士学位。结业后担任于内华达单细胞分子表达核心结合主任,担任单细胞测序数据阐发流程的开辟及机构办理工作。

  次要成绩:开辟了一套检测可变剪切的高效算法,并在国际上颁发了15篇相关文章。曾为美国Texas大学,Washington大学等客户量身定制了专业的单细胞个性化研究策略,并擅长对时下单细胞研究中,最抢手的微流控系统及高通量系统进行优化改善。

  次要研究标的目的:精子发育、胚胎晚期发育、二代测序方式学研究,并在国际高程度期刊上颁发论文十余篇。

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